До редактора:
През последните месеци омикрон (B.1.1.529) се превърна в доминиращ вариант на тежък остър респираторен синдром коронавирус 2 (SARS-CoV-2), показващ известна степен на имунно избягване.1 Първичните подварианти на омикрон, BA.1 и BA.2, постепенно се изместват от BA.5 в много страни, вероятно поради повишена трансмисивност и частично избягване на имунитета, причинени от BA.1 и BA.2.2,3 Защитата, осигурена от BA.1 срещу инфекция от подпроменливата BA.5, е критична, тъй като адаптираните ваксини в клиничните изпитвания се основават на BA.1.
Португалия беше една от първите страни, засегнати от господството на BA.5. Използвахме Националния регистър за коронавирусна болест 2019 (Covid-19) (SINAVE), за да изчислим риска от инфекция с BA.5 сред субекти с документирана инфекция с предишни варианти, включително BA.1 и BA.2. Регистърът включва всички регистрирани случаи в страната, независимо от клиничната изява.
Както е показано в панел (а), идентифицирахме периодите (в различни цветове), в които единичен вариант е представен в повече от 90% от пробните изолати (данни от националния тежък остър респираторен синдром коронавирус 2). [SARS-CoV-2] контрол на генетичното разнообразие4). Периодите в сиво представляват моментите, когато повече от една променлива е била в обращение. Предвид сравнително бавния преход между доминирането на варианта omicron BA.1 и доминирането на варианта omicron BA.2, ние обединихме BA.1 и BA.2 в анализа. Не включихме никакви субекти, заразени в рамките на 90 дни преди доминирането на субфактора omicron BA.5. Панел Б показва ефикасността на защитата срещу инфекция по време на контролния период на BA.5 (от 1 юни 2022 г.) сред субекти с единична инфекция в периодите на доминиране на различните варианти, както е показано в панел А, в сравнение с субекти без документиран инфекция от 1 юни. Хората с инфекция преди 1 юни не са включени в проучването. 𝙸 Лентите представляват 95% доверителни интервали.
Националното генетично наблюдение за SARS-CoV-2 идентифицира периоди, в които различни варианти представляват повече от 90% от изолатите.4 Идентифицирахме всички субекти, които са имали първата си инфекция в контролните периоди за всяка променлива, за да изчислим техния риск от инфекция по време на контролния период BA.5 (Фигура 1а). Обединихме BA.1 и BA.2 поради бавния преход между двете подпроменливи в популацията. И накрая, изчислихме риска от BA.5 за население, което не е имало документирана инфекция преди доминирането на BA.5 (1 юни 2022 г.).
Установихме, че предишна инфекция със SARS-CoV-2 е имала защитен ефект срещу инфекция с BA.5 (Фигура 1b и Таблица S1 в Допълнителното приложение, достъпно с пълния текст на това писмо на NEJM.org), и тази защита е била максимална за предишна инфекция с BA.1 или BA.2. Тези данни трябва да се разглеждат в контекста на проникващата инфекция при високо ваксинирана популация, като се има предвид, че повече от 98% от изследваната популация в Португалия е завършила първичната ваксинационна серия преди 2022 г.
Дизайнът на изследването не може да елиминира всички объркващи фактори (вижте дискусионния раздел в Допълнителното приложение). В допълнение, едно ограничение е предполагаемият ефект от намален имунитет в популация с хетерозиготен имунитет (предишна инфекция и ваксинация). Установихме, че инфекцията с BA.1 или BA.2 при ваксинирани субекти осигурява по-висока защита срещу BA.5, отколкото инфекцията с варианти преди омикрон, в съответствие с скорошен доклад за отрицателен дизайн на теста.5 Инфекциите с BA.1 или BA.2 обаче са настъпили по-близо до периода на доминиране на BA.5, отколкото инфекциите с по-ранни варианти. Има схващане, че защитата, предлагана от предишна инфекция с BA.1 или BA.2, е много ниска, предвид големия брой инфекции с BA.5 сред лица, заразени преди това с вируса BA.1 или BA.2. Нашите данни предполагат, че това възприятие вероятно е резултат от по-голяма група субекти с BA.1 или BA.2 инфекция в сравнение с инфекция от други подпроменливи и не се подкрепя от данните.
Като цяло открихме, че проникващите инфекции с варианта BA.5 са по-малко вероятни сред хора с предишна анамнеза за SARS-CoV-2 в силно ваксинирана популация, особено за предишни инфекции BA.1 или BA.2, отколкото сред неинфектирани лица .. .
Жоао Малато, MA.
Molecular Instituto de Medicina João Lobo Antunes, Лисабон, Португалия
Рой М. Рибейро, Фил Д.
Национална лаборатория в Лос Аламос, Лос Аламос, Ню Мексико
Педро П. Лейте, д-р
Педро Касака, д-р
Евгения Фернандес, д-р.
Direção Geral da Saúde, Лисабон, Португалия
Карлос Антунес, Ph.D.
Университет на Лисабон, Лисабон, Португалия
Валтер Р. Фонсека, MD, Ph.D.
Direção Geral da Saúde, Лисабон, Португалия
Мануел С. Гомес, д-р.
Университет на Лисабон, Лисабон, Португалия
Луис Грака, доктор по медицина, Фил Д.
Molecular Instituto de Medicina João Lobo Antunes, Лисабон, Португалия
[email protected]
С подкрепата на Европейския съюз
Формулярите за разкриване, предоставени от авторите, са достъпни с пълния текст на това писмо на NEJM.org.
Това съобщение беше публикувано на 31 август 2022 г. в NEJM.org.
д-р. Гомес и Грака допринесоха еднакво за това послание.
-
1. чо бИ на Варони ДжИ на Евънс Дж.Б, и други. Неутрализиране на SARS-CoV-2 омикрон подварианти BA.4/5 и BA.2.12.1. В Angel J Med 2022 г; 386:2526–2528.
-
2. йо cИ на Колиър АИ на ro m, и други. Неутрализиране на SARS-CoV-2 омикрон варианти BA.1 и BA.2. В Angel J Med 2022 г; 386:1579–1580.
-
3. Цао УейИ на ЙисимайИ на Джиан Ф, и други. Антитела, причинени от омикрон инфекция BA.2.12.1, BA.4 и BA.5. нрав природа 2022 г; 608:593–602.
-
4. Instituto Nacional de Saúde Doutor Рикардо Хорхе. Генетично разнообразие на новия коронавирус SARS-CoV-2 (COVID-19) в Португалия. (на португалски) 2022 г (https://insaflu.insa.pt/covid19).
-
5. Tarawneh hИ на Кимители ХИ на Аюб Сму, и други. Защита от естествена SARS-CoV-2 инфекция срещу повторно заразяване с подварианти на omicron BA.4 или BA.5. Юли 12И на 2022 г (https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.07.11.22277448v1). предпечат.
„Тотален фен на Twitter. Нежно очарователен почитател на бекона. Сертифициран специалист по интернет.“
More Stories
SpaceX стартира мисия Starlink от Кейп Канаверал
Физиците казват, че може да са открили мощен дисбаланс във Вселената
Семейство моли за помощ, след като 10-годишно момче от Южна Калифорния беше диагностицирано с рядък рак на мозъка